Diversidad genética de ovinos criollos colombianos

Los ovinos al igual que otros animales domésticos, no son originarios del continente Americano. Estos animales llegaron desde España, primero en calidad de alimento para los navegantes y conquistadores, y luego como pie de cría para los primeros colonos y religiosos. El criollo es un animal rústico, de gran fertilidad y de importancia económica para Boyacá, Cundinamarca, Nariño y Santander, su amplia adaptación hace que fácilmente se encuentre desde las zonas áridas de la Guajira hasta los páramos húmedos de la zona Andina. Los objetivos principales del presente trabajo fueron estudiar la diversidad genética de los ovinos criollos colombianos (OCC) y evaluar si existe diferenciación genética entre los ovinos criollos colombianos de pelo variedades Etíope (CE), Sudán (CS) y Abisinio (CA), mediante el uso de 15 marcadores microsatélites. Se recolectaron muestra de 291 animales de los grupos genéticos Criolla de Lana (CL), Mora Colombiana (MC), Criollo de Pelo (CP), Hampshire (Hamp), Corriedale (Corr), Katahdin (Kath), Pelibuey (Pel), Merino Español (ME), Merino Precoz (MP), Merinofleischschaf (MF), Segureño (Seg) y Uda (UD). Las muestras fueron recolectadas en 40 fincas de 8 departamentos (Córdoba, Magdalena, Cesar, Atlántico, Valle del Cauca, Nariño, Boyacá y Tolima). El número promedio de alelos encontrado en CL (6.20±1.48) y CP (7.27±1.39), además de los altos valores de Heterocigosidad hallados en estos grupos genéticos, superiores al 75%, fueron similares a los reportados en estudios de diversidad genética en ovinos criollos de América. Además de los altos valores hallados en la He se encontraron valores negativos en el índice de fijación FIS que revelaron alto grado de introgresión para gran parte de la población ovina muestreada (a excepción de los animales del departamento de Córdoba), lo anterior fue corroborado con la distancia mínima de Nei (1972) y en el análisis bayesiano. Cuando se analizó a las variedades CS, CE y CA se encontró estructura genética entre ellas (FST= 0.02); CS fue significativamente diferente de CE y CA, mientras que estas dos últimas presentaron similitud genética (FST =0.0 ns). Según la distancia genética y el análisis bayesiano los ovinos criollos colombianos presentan diferencias con los ovinos foráneos ME, MP, MF y UD. Los resultados obtenidos recomiendan proteger la ovinocultura criolla puesto que se encuentra amenazada por los constantes cruzamientos con razas foráneas, lo que conllevaría a pérdida de la identidad genética y de los rasgos de adaptación propios de los animales criollos. aqui termina el resumen en español.//Abstract: The sheep like other pets, do not originate in the Americas. These animals came from Spain, first as food for sailors and conquerors, and later as breeding stock for the early settlers and religious. The creole is a hardy animal, high fertility and economic importance to Boyaca, Cundinamarca, Nariño and Santander, wide adaptation is easily causes from the arid Guajira to the moors humid Andean area. The main objectives of this work were to study the genetic diversity of the Colombian native sheep (OCC) and assess whether genetic differentiation between hair sheep Colombian Creole varieties Etíope (EC), Sudan (CS) and Abisinia (CA), using the Using 15 microsatellites. Sample were collected from 291 animals Creole Lana (CL), Mora Colombiana (MC), Hair Creole (CP), Hampshire (Hamp), Corriedale (Corr), Katahdin (Kath), sheep (Pel), Spanish Merino (ME), Merino Precocious (MP), Merinofleischschaf (MF), Segureño (Sec) and Uda (UD). Samples were collected from 40 farms in eight departments (Córdoba, Magdalena, Cesar, Atlántico, Valle del Cauca, Nariño, Boyacá and Tolima). The average number of alleles found in CL (6.20 ± 1.48) and CP (7.27 ± 1.39), in addition to the high values of heterozygosis found in these genetic groups, over 75%, were similar to those reported in studies of genetic diversity in native sheep of America. In addition to high heterozygosis values found in the negative values were found in the fixation index FIS introgression revealed high for much of the sheep population sampled (except for the animals of the department of Cordoba), the above was corroborated by the minimum distance of Nei (1972) and Bayesian analysis. When analyzed the varieties CS, CE and CA was found genetic structure including (FST = 0.02) was significantly different CS CE and CA, while the latter two showed genetic similarity (FST = 0.0 ns). According to the genetic distance and Bayesian analysis Colombian Creole sheep differ with outsiders ME, MP, MF and UD. The results recommend protecting Creole sheep production since it is constantly threatened by crossbreeding with foreign breeds, which would lead to loss of genetic identity and adaptive traits of the animals themselves Creoles.Maestrí

Caracterización genética de ovinos criollos colombianos

ABSTRACT: indigenous breeds are important for poor farmers because of their natural selection against harsh environments and adaptation to regional conditions. However, inbreeding of indigenous sheep populations has increased in Colombia due to indiscriminate cross-breeding with foreign animals and lack of reproductive controls, with subsequent loss in productivity, which poses a great risk for the conservation of valuable genes. Objective: to determine the genetic diversity in Colombian indigenous sheep by using a panel of 10 microsatellite molecular markers. Methods: blood samples from 362 individuals from 43 farms in 11 Colombian provinces were genotyped and analyzed for a panel of 10 microsatellite markers. Results: a total of 134 alleles were found (13.4 alleles/locus on average) with a range of observed and expected heterozygosity of 0.428 to 0.831 and 0.615 to 0.855, respectively, and 0.742 polymorphic information content (PIC). The average Wright F-statistics (FIS ) of the breeds was 0.107, suggesting moderate levels of inbreeding. Colombian sheep showed a low level of genetic differentiation among breeds (FST = 0.054) and STRUCTURE analysis showed complex patterns of admixture in the breeds. Conclusion: overall, Colombian sheep have high genetic variability, which is very important for future conservation programs and genetic improvement.RESUMEN: las razas animales autóctonas son importantes para los agricultores de escasos recursos a causa de su selección natural contra el duro ambiente y su adaptación a condiciones regionales. Sin embargo en Colombia, debido al cruce indiscriminado con razas foráneas y a la falta de control de la reproducción, ha aumentado la consanguinidad en las poblaciones de ovinos criollos y por lo tanto la pérdida en la productividad, lo que supone un gran riesgo para la conservación de genes valiosos. Objetivo: determinar la diversidad genética en razas criollas de ovinos colombianos utilizando análisis por microsatélites. Métodos: se visitaron 43 granjas localizadas en 11 departamentos del país, en las cuales se tomaron muestras de sangre a 362 individuos. Las muestras fueron genotipadas y analizadas para un panel de 10 marcadores microsatélites. Resultados: un total de 134 alelos fueron encontrados (13,4 alelos/locus en promedio), con un rango de heterocigocidad observada y esperada de 0,428 a 0,831 y 0,615 a 0,855, respectivamente, y un contenido de información polimórfica (PIC) promedio de 0,742. El Wright F-statistics (FIS) promedio de las razas evaluadas fue 0,107, lo cual sugiere que las razas tienen niveles moderados de consanguinidad. Las ovejas colombianas presentaron un bajo grado de diferenciación genética entre las distintas razas (FST = 0,054) y el análisis de STRUCTURE mostro complejos patrones de mezcla en las razas estudiadas. Conclusión: en términos generales, las ovejas colombianas presentan una alta variabilidad genética lo cual es muy importante para futuros programas de conservacion y mejoramiento genetico

Genetic characterization of four populations of argentinian creole sheep

Creole sheep are the founders of sheep farming in Argentina and have contributed in a sustained way to the economic, social and cultural development of some regions of this country. However, it is a scarcely valorised and poorly studied genetic resource. In order to genetically characterize the Argentinian Creole sheep, DNA samples were taken from four representative populations located in the provinces of Buenos Aires, Corrientes, Santiago del Estero and Salta. These flocks were selected because they are considered to be conserved groups, they have the phenotypic characteristics of the creole breed and there are no records about the introduction of animals of other breeds into those systems. A total of 30 microsatellites and the D-loop region of mitochondrial DNA were analysed. Microsatellite analysis showed high level of genetic diversity within populations (Ho= 0.676; He= 0.685; PIC= 0.713). This variability is explained by differences between molecular patterns of the studied individuals, which can be classified into three significantly different population groups: BA, SA, SE+CO. Since these populations explain very little of the total variability (7.6%), it can be considered that they belong to a same race. The analysis of the mitochondrial D-loop showed that Argentinian Creole sheep have haplotypes belonging to the Asian haplogroup, which is widely distributed in the Spanish breeds, which are considered to be their ancestors. The results obtained in the present study will provide information to develop management criteria for this genetic resource in Argentina, in order to implement their conservation, recovery and/or to develop breeding programs.Los ovinos criollos son los fundadores de la ganadería ovina en la Argentina y han contribuido de manera sostenida al desarrollo económico, social y cultural de algunas regiones del país. A pesar de ello, es un recurso zoogenético escasamente valorizado y por ende poco estudiado. En orden de caracterizar genéticamente a los ovinos criollos argentinos, se tomaron muestras de ADN de cuatro poblaciones representativas localizadas en las provincias de Buenos Aires, Corrientes, Santiago del Estero y Salta. Estas majadas se seleccionaron por ser grupos conservados, que presentan las características fenotípicas de la raza y no registran la introducción de animales de otras razas en el sistema de reproducción. Un total de 30 marcadores microsatélites y la región D-loop del ADN mitocondrial fueron analizados. El análisis de los microsatélites permitió evidenciar una alta diversidad genética intrapoblacional (Ho= 0,676; He= 0,685; PIC= 0,713). Dicha variabilidad es explicada por diferencias entre los patrones moleculares de los individuos estudiados que pueden clasificarse en 3 grupos de poblaciones significativamente diferentes: BA, SA, SE+CO. Dado que dichas poblaciones explican muy poco de la variabilidad total (7,6%), ellas deberían considerarse perteneciente a una misma raza. El análisis del D-loop mitocondrial demostró que los individuos analizados están relacionados con el haplogrupo asiático, el cual está ampliamente distribuido en las razas españolas que son las antecesoras de la raza criolla argentina. Los resultados obtenidos en este trabajo proveerán información para establecer criterios de manejo de este recurso genético de Argentina con el fin de implementar planes de conservación, recuperación y/o mejora de los programas.Facultad de Ciencias Veterinarias (FCV)Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales (FCAF

Genetic characterization of four populations of argentinian creole sheep

Creole sheep are the founders of sheep farming in Argentina and have contributed in a sustained way to the economic, social and cultural development of some regions of this country. However, it is a scarcely valorised and poorly studied genetic resource. In order to genetically characterize the Argentinian Creole sheep, DNA samples were taken from four representative populations located in the provinces of Buenos Aires, Corrientes, Santiago del Estero and Salta. These flocks were selected because they are considered to be conserved groups, they have the phenotypic characteristics of the creole breed and there are no records about the introduction of animals of other breeds into those systems. A total of 30 microsatellites and the D-loop region of mitochondrial DNA were analysed. Microsatellite analysis showed high level of genetic diversity within populations (Ho= 0.676; He= 0.685; PIC= 0.713). This variability is explained by differences between molecular patterns of the studied individuals, which can be classified into three significantly different population groups: BA, SA, SE+CO. Since these populations explain very little of the total variability (7.6%), it can be considered that they belong to a same race. The analysis of the mitochondrial D-loop showed that Argentinian Creole sheep have haplotypes belonging to the Asian haplogroup, which is widely distributed in the Spanish breeds, which are considered to be their ancestors. The results obtained in the present study will provide information to develop management criteria for this genetic resource in Argentina, in order to implement their conservation, recovery and/or to develop breeding programs.Los ovinos criollos son los fundadores de la ganadería ovina en la Argentina y han contribuido de manera sostenida al desarrollo económico, social y cultural de algunas regiones del país. A pesar de ello, es un recurso zoogenético escasamente valorizado y por ende poco estudiado. En orden de caracterizar genéticamente a los ovinos criollos argentinos, se tomaron muestras de ADN de cuatro poblaciones representativas localizadas en las provincias de Buenos Aires, Corrientes, Santiago del Estero y Salta. Estas majadas se seleccionaron por ser grupos conservados, que presentan las características fenotípicas de la raza y no registran la introducción de animales de otras razas en el sistema de reproducción. Un total de 30 marcadores microsatélites y la región D-loop del ADN mitocondrial fueron analizados. El análisis de los microsatélites permitió evidenciar una alta diversidad genética intrapoblacional (Ho= 0,676; He= 0,685; PIC= 0,713). Dicha variabilidad es explicada por diferencias entre los patrones moleculares de los individuos estudiados que pueden clasificarse en 3 grupos de poblaciones significativamente diferentes: BA, SA, SE+CO. Dado que dichas poblaciones explican muy poco de la variabilidad total (7,6%), ellas deberían considerarse perteneciente a una misma raza. El análisis del D-loop mitocondrial demostró que los individuos analizados están relacionados con el haplogrupo asiático, el cual está ampliamente distribuido en las razas españolas que son las antecesoras de la raza criolla argentina. Los resultados obtenidos en este trabajo proveerán información para establecer criterios de manejo de este recurso genético de Argentina con el fin de implementar planes de conservación, recuperación y/o mejora de los programas.Facultad de Ciencias Veterinarias (FCV)Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales (FCAF

Genetic characterization of four populations of argentinian creole sheep

Creole sheep are the founders of sheep farming in Argentina and have contributed in a sustained way to the economic, social and cultural development of some regions of this country. However, it is a scarcely valorised and poorly studied genetic resource. In order to genetically characterize the Argentinian Creole sheep, DNA samples were taken from four representative populations located in the provinces of Buenos Aires, Corrientes, Santiago del Estero and Salta. These flocks were selected because they are considered to be conserved groups, they have the phenotypic characteristics of the creole breed and there are no records about the introduction of animals of other breeds into those systems. A total of 30 microsatellites and the D-loop region of mitochondrial DNA were analysed. Microsatellite analysis showed high level of genetic diversity within populations (Ho= 0.676; He= 0.685; PIC= 0.713). This variability is explained by differences between molecular patterns of the studied individuals, which can be classified into three significantly different population groups: BA, SA, SE+CO. Since these populations explain very little of the total variability (7.6%), it can be considered that they belong to a same race. The analysis of the mitochondrial D-loop showed that Argentinian Creole sheep have haplotypes belonging to the Asian haplogroup, which is widely distributed in the Spanish breeds, which are considered to be their ancestors. The results obtained in the present study will provide information to develop management criteria for this genetic resource in Argentina, in order to implement their conservation, recovery and/or to develop breeding programs.Los ovinos criollos son los fundadores de la ganadería ovina en la Argentina y han contribuido de manera sostenida al desarrollo económico, social y cultural de algunas regiones del país. A pesar de ello, es un recurso zoogenético escasamente valorizado y por ende poco estudiado. En orden de caracterizar genéticamente a los ovinos criollos argentinos, se tomaron muestras de ADN de cuatro poblaciones representativas localizadas en las provincias de Buenos Aires, Corrientes, Santiago del Estero y Salta. Estas majadas se seleccionaron por ser grupos conservados, que presentan las características fenotípicas de la raza y no registran la introducción de animales de otras razas en el sistema de reproducción. Un total de 30 marcadores microsatélites y la región D-loop del ADN mitocondrial fueron analizados. El análisis de los microsatélites permitió evidenciar una alta diversidad genética intrapoblacional (Ho= 0,676; He= 0,685; PIC= 0,713). Dicha variabilidad es explicada por diferencias entre los patrones moleculares de los individuos estudiados que pueden clasificarse en 3 grupos de poblaciones significativamente diferentes: BA, SA, SE+CO. Dado que dichas poblaciones explican muy poco de la variabilidad total (7,6%), ellas deberían considerarse perteneciente a una misma raza. El análisis del D-loop mitocondrial demostró que los individuos analizados están relacionados con el haplogrupo asiático, el cual está ampliamente distribuido en las razas españolas que son las antecesoras de la raza criolla argentina. Los resultados obtenidos en este trabajo proveerán información para establecer criterios de manejo de este recurso genético de Argentina con el fin de implementar planes de conservación, recuperación y/o mejora de los programas.Facultad de Ciencias Veterinarias (FCV)Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales (FCAF

Caracterización genética de cuatro poblaciones de ovinos criollos de Argentina

Creole sheep are the founders of sheep farming in Argentina and have contributed in a sustained way to the economic, social and cultural development of some regions of this country. However, it is a scarcely valorised and poorly studied genetic resource. In order to genetically characterize the Argentinian Creole sheep, DNA samples were taken from four representative populations located in the provinces of Buenos Aires, Corrientes, Santiago del Estero and Salta. These flocks were selected because they are considered to be conserved groups, they have the phenotypic characteristics of the creole breed and there are no records about the introduction of animals of other breeds into those systems. A total of 30 microsatellites and the D-loop region of mitochondrial DNA were analysed. Microsatellite analysis showed high level of genetic diversity within populations (Ho= 0.676; He= 0.685; PIC= 0.713). This variability is explained by differences between molecular patterns of the studied individuals, which can be classified into three significantly different population groups: BA, SA, SE+CO. Since these populations explain very little of the total variability (7.6%), it can be considered that they belong to a same race. The analysis of the mitochondrial D-loop showed that Argentinian Creole sheep have haplotypes belonging to the Asian haplogroup, which is widely distributed in the Spanish breeds, which are considered to be their ancestors. The results obtained in the present study will provide information to develop management criteria for this genetic resource in Argentina, in order to implement their conservation, recovery and/or to develop breeding programs.Los ovinos criollos son los fundadores de la ganadería ovina en la Argentina y han contribuido de manera sostenida al desarrollo económico, social y cultural de algunas regiones del país. A pesar de ello, es un recurso zoogenético escasamente valorizado y por ende poco estudiado. En orden de caracterizar genéticamente a los ovinos criollos argentinos, se tomaron muestras de ADN de cuatro poblaciones representativas localizadas en las provincias de Buenos Aires, Corrientes, Santiago del Estero y Salta. Estas majadas se seleccionaron por ser grupos conservados, que presentan las características fenotípicas de la raza y no registran la introducción de animales de otras razas en el sistema de reproducción. Un total de 30 marcadores microsatélites y la región D-loop del ADN mitocondrial fueron analizados. El análisis de los microsatélites permitió evidenciar una alta diversidad genética intrapoblacional (Ho= 0,676; He= 0,685; PIC= 0,713). Dicha variabilidad es explicada por diferencias entre los patrones moleculares de los individuos estudiados que pueden clasificarse en 3 grupos de poblaciones significativamente diferentes: BA, SA, SE+CO. Dado que dichas poblaciones explican muy poco de la variabilidad total (7,6%), ellas deberían considerarse perteneciente a una misma raza. El análisis del D-loop mitocondrial demostró que los individuos analizados están relacionados con el haplogrupo asiático, el cual está ampliamente distribuido en las razas españolas que son las antecesoras de la raza criolla argentina. Los resultados obtenidos en este trabajo proveerán información para establecer criterios de manejo de este recurso genético de Argentina con el fin de implementar planes de conservación, recuperación y/o mejora de los programas

Polimorfismos de nucleótido simple en hormonas asociadas al crecimiento muscular en ovinos criollos colombianos

Objective. To determine the Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) present in growth hormone (GH) and insulin like growth factor 1 (IGF-1) genes and their association with muscle growth in Colombian Creole hair sheep. Materials and methods. A populationof 100 sheep was selected, from three different regions: Andean valleys, Piedemonte Llanero and Córdoba department, subjected to different production systems. Polymorphisms identification was determined by the Polymerase Chain Reaction (PCR) and Single Chain Conformation Polymorphism (SSCP) techniques. Results. AA, AB and BB genotypes were identified for these genes. Allele frequencies were defined for the GH and IGF-1 (IGFov-1, IGF1ov-2 and IGF1ov-3) markers of 58.9, 36.87, 53.76 and 56.81% for alleleA, respectively, and 41.41, 63.13, 46.24 and 43.18% for allele B, respectively. Genotypic frequencies were also determined for each marker at the population level, calculated from the Hardy-Weinberg equilibrium with a Fis correlation analysis. Conclusion. The selected markers present a high level of homology in the selected population, and it was determined that there is a high percentage of heterozygous individuals based on the markers evaluated.Objetivo. Determinar Polimorfismos de Nucleótido Simple (SNPs) presentes en los genes de la Hormona del Crecimiento (HC) y del Factor de Crecimiento Semejante a la Insulina 1 (IGF-1) y su asociación con el crecimiento muscular en ovinos de pelo criollos colombianos. Materiales y métodos. Se seleccionó una población de 100 ovinos, de tres regiones diferentes: Valles interandinos, Piedemonte Llanero y departamento de Córdoba, sometidos a diferentes sistemas de producción. La identificación de polimorfismos en los genes se realizó mediante las técnicas de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) y de Polimorfismo Conformacional de Cadena Sencilla (SSCP). Resultados. Se identificaron los genotipos AA, AB y BB para dichos genes. Las frecuencias alélicas para los marcadores HC, IGF-1 (IGFov-1, IGF1ov-2 e IGF1ov-3) fueron de 58,9, 36,87, 53,76 y 56,81% para el alelo A, respectivamente, y de 41,41, 63,13, 46,24 y 43,18% para el alelo B, respectivamente. Asimismo, se determinaron las frecuencias genotípicas para cada marcador a nivel poblacional, calculado a partir del equilibrio de Hardy-Weinberg con un análisis de correlación Fis. Conclusión. Los marcadores seleccionados presentaron un alto nivel de homología en la población seleccionada, lográndose determinar que existe un alto porcentaje de individuos heterocigotos con base a los marcadores evaluados.

Caracterización seminal de individuos ovinos criollos colombianos de pelo en el departamento de Sucre

The aim of this study was to characterize the semen of sheep individuals Colombian Creole hair on the farm at the University of Sucre. The study was carried out on the farm “El Perico” of the University of Sucre, 50 meters, warm dry climate and vegetation formation of tropical dry forest. four crossbred sheep adults, unrelated, which were collected four times at intervals of five days, using the technique of electroejaculation and seminal characteristics were evaluated macroscopic and microscopic were used. It was found that the predominant color is white matte (66.7%) followed by bright white (33.3%) (p<0.05), the seminal aspect is creamy (60%), the average weekly volume is 1.41 ± 0,11ml, individual mobility is 74.09 ± 2%, gross motility is 3.77 ± 0.12 and the average sperm concentration of 711,89x106 ± 133,86x106esp / ml. It was found that 76.64 ± 1.99% spermatozoa have normal morphology and 80.47 ± 1.28% of the sperm had a functional plasma membrane. The seminal evaluation helped to show that the semen of crossbred sheep show similar to those reported in foreign breeds, although with higher volumes and higher percentage of membrane integrity features. It is concluded that the semen of Colombian creole hair sheep, has characteristics similar to other breeds quality, allowing it to be used in breeding programs.El objetivo de este trabajo fue caracterizar el semen de individuos ovinos criollos colombianos de pelo en la granja de la Universidad de Sucre. El estudio se llevó a cabo en la granja “El Perico” de la Universidad de Sucre, a 50 msnm, clima cálido seco y con formación vegetal de bosque seco tropical. Se utilizaron cuatro ovinos criollos adultos, no emparentados, los cuales fueron colectados cuatro veces a intervalos de cinco días, mediante la técnica de electroeyaculación y se evaluaron las características seminales macroscópicas y microscópicas. Se encontró que el color predominante es el blanco mate (66,7%) seguido del blanco brillante (33,3%) (p<0.05), el aspecto seminal es cremoso (60%), el volumen seminal promedio es 1,41±0,11ml, la movilidad individual es 74,09±2%, la movilidad masal es del 3,77±0,12 y la concentración espermática promedio de 711,89x106±133,86x106esp/ml. Se encontró que el 76,64±1,99% de los espermatozoides tenían una morfología normal y el 80,47±1,28% de los espermas presentaron una membrana plasmática funcional. La evaluación seminal permitió demostrar que el semen de los ovinos criollos, presentan características similares a las reportadas en razas foráneas, aunque con mayores volúmenes y mejor porcentaje de integridad de membrana. Se concluye que el semen de los ovinos criollos colombianos de pelo, presenta características de calidad similares a otras razas, lo que le permite ser usado en programas mejoramiento genético

Genetic diversity of the Colombian Creole Sheep by using the single nucleotide polymorphisms (SNP) molecular marker

El estudio tuvo como objetivo caracterizar genéticamente la población de Ovinos Criollos de Pelo Colombiano (OCPC) de dos zonas geográficas del país, el Piedemonte Llanero (PDML) y los Valles Interandinos del Río Magdalena (VIRM). Se tomaron muestras de músculo para la extracción de ADN mediante la metodología fenol cloroformo isoamílico. El genotipado se hizo con el OvineSNP50 BeadChip Data Sheet. Los genotipos fueron analizados con el software PLINK v.1.9 en busca de relaciones de consanguinidad y parentesco. Los análisis estadísticos de los datos se realizaron con el uso de los paquetes “genepop” y “adegenet” del software R. Los resultados mostraron una heterocigosidad esperada de 0.374 para el OCPC, mientras que fue de 0.357 para la zona de PDML y de 0.396 para la zona de VIRM. Los valores para los parámetros del coeficiente de consanguinidad (Fis y Fit) fueron positivos para la población y las subpoblaciones, demostrando la existencia de consanguinidad. El valor para el Fst fue de 0.042 entre subpoblaciones definidas como zonas geográficas (p<0.001), lo que sugiere que la población analizada corresponda a dos grupos raciales. Esto es apoyado con el análisis de componentes principales donde se evidencia una tendencia de aislamiento entre los individuos para cada zona geográfica. En conclusión, se puede afirmar que, la diversidad genética de la población de Ovino Criollo de Pelo Colombiano, comparada con otras razas ovinas a nivel mundial, es elevada.The aim of this study was to genetically characterize the population of the Colombian Creole Hair Sheep (CCHS) from two geographical areas of the country, the Piedemonte Llanero (PDML) and the Interandine Valleys of the Magdalena River (VIRM). Muscle samples were taken and DNA was extracted using the phenol chloroform isoamyl methodology. Genotyping was done with the OvineSNP50 BeadChip Data Sheet. The genotypes were analysed with the PLINK v.1.9 software for relationships of consanguinity and kinship. Statistical analyses of the data were performed using the “genepop” and “adegenet” packages of the R software. The results showed an expected heterozygosity of 0.374 for the CCHS, while it was 0.357 for the PDML area and 0.396 for the VIRM zone. The values ​​for the parameters of the consanguinity coefficient (Fis and Fit) were positive for the population and subpopulations, proving the existence of consanguinity. The value for the Fst was 0.042 among subpopulations defined as geographical areas (p<0.001), which suggests that the population analysed corresponds to two breed groups. This is supported by the analysis of principal components where there is evidence of a tendency of isolation among individuals for each geographical area. In conclusion, it is valid to say that the genetic diversity of the population of Colombian Creole Hair Sheep, compared to other sheep breeds worldwide, is high

Genetic characterization of Colombian indigenous sheep

Background: indigenous breeds are important for poor farmers because of their natural selection against harsh environments and adaptation to regional conditions. However, inbreeding of indigenous sheep populations has increased in Colombia due to indiscriminate cross-breeding with foreign animals and lack of reproductive controls, with subsequent loss in productivity, which poses a great risk for the conservation of valuable genes. Objective: to determine the genetic diversity in Colombian indigenous sheep by using a panel of 10 microsatellite molecular markers. Methods: blood samples from 362 individuals from 43 farms in 11 Colombian provinces were genotyped and analyzed for a panel of 10 microsatellite markers. Results: a total of 134 alleles were found (13.4 alleles/locus on average) with a range of observed and expected heterozygosity of 0.428 to 0.831 and 0.615 to 0.855, respectively, and 0.742 polymorphic information content (PIC). The average Wright F-statistics (FIS) of the breeds was 0.107, suggesting moderate levels of inbreeding. Colombian sheep showed a low level of genetic differentiation among breeds (FST = 0.054) and STRUCTURE analysis showed complex patterns of admixture in the breeds. Conclusion: overall, Colombian sheep have high genetic variability, which is very important for future conservation programs and genetic improvement